Nhạc viện Thượng Hải có các chương trình đào tạo 5 năm. Trường được giao đào tạo cử nhân, thạc sĩ và tiến sĩ. Trường có 8 khoa:

• Âm nhạc học;
• Sáng tác và Chỉ huy;
• Thanh nhạc;
• Piano;
• Nhạc cụ dàn nhạc;
• Nhạc cụ Trung Hoa;
• Sư phạm âm nhạc và Nhạc kịch.

Nhạc viện Thượng Hải cũng có viện nghiên cứu âm nhạc, một trường tiểu học, một trường trung học và một xưởng nhạc cụ.